Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SF3B2Q13435 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SF3B2Q13435 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms