Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SP140Q13342 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SP140Q13342 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SP140Q13342 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SP140Q13342 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SP140Q13342 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
SP140Q13342 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SP140Q13342 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SP140Q13342 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SP140Q13342 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms