Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
STRN3Q13033 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
STRN3Q13033 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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