Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSTF3Q12996 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSTF3Q12996 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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