Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTP4A2Q12974 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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