Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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HOXC5Q00444 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
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HOXC5Q00444 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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HOXC5Q00444 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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HOXC5Q00444 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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HOXC5Q00444 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
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HOXC5Q00444 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
HOXC5Q00444 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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