Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERFP50548 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERFP50548 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERFP50548 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERFP50548 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERFP50548 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERFP50548 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERFP50548 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERFP50548 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERFP50548 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERFP50548 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERFP50548 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ERFP50548 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
ERFP50548 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ERFP50548 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERFP50548 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERFP50548 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERFP50548 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ERFP50548 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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