Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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