Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CTIFO43310 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CTIFO43310 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CTIFO43310 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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