Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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