Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCL28Q9NRJ3 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.9 ms