Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
HOXD1Q9GZZ0 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms