Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CIPCQ9C0C6 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.1 ms