Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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CITED1Q99966 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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CITED1Q99966 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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CITED1Q99966 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
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CITED1Q99966 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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CITED1Q99966 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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CITED1Q99966 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CITED1Q99966 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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