Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN4Q92575 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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