Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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