Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CCDC142Q17RM4 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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CCDC142Q17RM4 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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CCDC142Q17RM4 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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CCDC142Q17RM4 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC142Q17RM4 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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CCDC142Q17RM4 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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CCDC142Q17RM4 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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CCDC142Q17RM4 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC142Q17RM4 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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