Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP2B3Q16720 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ATP2B3Q16720 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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