Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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CTF1Q16619 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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CTF1Q16619 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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