Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SGCBQ16585 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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