Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SSX1Q16384 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SSX1Q16384 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SSX1Q16384 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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