Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATP6AP1Q15904 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATP6AP1Q15904 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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