Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
NPTX1Q15818 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NPTX1Q15818 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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