Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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