Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
HMGN3Q15651 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HMGN3Q15651 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HMGN3Q15651 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HMGN3Q15651 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HMGN3Q15651 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HMGN3Q15651 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HMGN3Q15651 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HMGN3Q15651 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HMGN3Q15651 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
HMGN3Q15651 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HMGN3Q15651 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
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