Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRRQ15256 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRRQ15256 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRRQ15256 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRRQ15256 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRRQ15256 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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PTPRRQ15256 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRRQ15256 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRRQ15256 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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PTPRRQ15256 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRRQ15256 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRRQ15256 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPRRQ15256 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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