Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
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SHPRHQ149N8 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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SHPRHQ149N8 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
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SHPRHQ149N8 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
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SHPRHQ149N8 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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SHPRHQ149N8 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
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SHPRHQ149N8 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
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SHPRHQ149N8 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
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SHPRHQ149N8 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SHPRHQ149N8 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
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