Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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GBX1Q14549 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GBX1Q14549 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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