Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RIGQ13278 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RIGQ13278 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RIGQ13278 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RIGQ13278 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RIGQ13278 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RIGQ13278 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RIGQ13278 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RIGQ13278 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
RIGQ13278 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms