Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SRSF5Q13243 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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