Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GRIN2BQ13224 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GRIN2BQ13224 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms