Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERCC8Q13216 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
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ERCC8Q13216 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ERCC8Q13216 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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