Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CBX3Q13185 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CBX3Q13185 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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