Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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