Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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PTPRDP23468 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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PTPRDP23468 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
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PTPRDP23468 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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PTPRDP23468 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
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PTPRDP23468 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRDP23468 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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