Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRFP10586 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRFP10586 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms