Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRCP08575 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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PTPRCP08575 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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PTPRCP08575 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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PTPRCP08575 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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PTPRCP08575 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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PTPRCP08575 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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PTPRCP08575 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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PTPRCP08575 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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PTPRCP08575 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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PTPRCP08575 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPRCP08575 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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