Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
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