Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP18Q9UMW8 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
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USP18Q9UMW8 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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USP18Q9UMW8 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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USP18Q9UMW8 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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USP18Q9UMW8 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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USP18Q9UMW8 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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USP18Q9UMW8 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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USP18Q9UMW8 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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USP18Q9UMW8 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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USP18Q9UMW8 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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USP18Q9UMW8 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP18Q9UMW8 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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