Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LHX9Q9NQ69 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LHX9Q9NQ69 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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