Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
FAM3DQ96BQ1 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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FAM3DQ96BQ1 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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FAM3DQ96BQ1 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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FAM3DQ96BQ1 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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FAM3DQ96BQ1 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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FAM3DQ96BQ1 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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FAM3DQ96BQ1 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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FAM3DQ96BQ1 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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FAM3DQ96BQ1 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
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FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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FAM3DQ96BQ1 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
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FAM3DQ96BQ1 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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FAM3DQ96BQ1 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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FAM3DQ96BQ1 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FAM3DQ96BQ1 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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