Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC47Q96A33 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
CCDC47Q96A33 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CCDC47Q96A33 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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