Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ZNF548Q8NEK5 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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