Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SGCAQ16586 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms