Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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