Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
RPE65Q16518 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPE65Q16518 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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