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| ATP6AP1 | Q15904 | AC005002.2-201 | ENST00000438228 | 269 nt | BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTND1P34-201 | ENST00000438556 | 671 nt | BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPS27P1-201 | ENST00000450552 | 247 nt | BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RN7SKP210-201 | ENST00000459176 | 261 nt | BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC004223.1-201 | ENST00000479840 | 271 nt | BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC069439.1-201 | ENST00000494739 | 167 nt | BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | RNA5SP445-201 | ENST00000515889 | 115 nt | BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC015688.6-201 | ENST00000577737 | 104 nt | BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC002553.4-201 | ENST00000616896 | 331 nt | BASIC | 1.16 | □□□□□ -2.22 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | KTN1-205 | ENST00000395314 | 4618 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 1.15 | □□□□□ -2.22 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | MIR4709-201 | ENST00000577272 | 72 nt | BASIC | 1.15 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC015845.1-201 | ENST00000579285 | 335 nt | TSL 3 BASIC | 1.15 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | KIAA1551-201 | ENST00000312561 | 6230 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL354864.1-201 | ENST00000373226 | 539 nt | TSL 2 BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNA5SP213-201 | ENST00000391031 | 106 nt | BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | USMG5P1-201 | ENST00000425964 | 177 nt | BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL589935.1-209 | ENST00000432050 | 418 nt | TSL 5 BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC099513.1-201 | ENST00000490423 | 301 nt | BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AF235103.2-201 | ENST00000525753 | 346 nt | BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL442163.3-201 | ENST00000554110 | 156 nt | BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL929325.1-201 | ENST00000603096 | 117 nt | BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC022217.4-201 | ENST00000604389 | 163 nt | BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC018462.2-201 | ENST00000605375 | 395 nt | BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC010999.1-201 | ENST00000611856 | 324 nt | BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL359075.3-201 | ENST00000613288 | 217 nt | BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR6715A-201 | ENST00000615929 | 79 nt | BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL353997.5-201 | ENST00000618886 | 171 nt | BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | CEP57L1-201 | ENST00000359793 | 2515 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | Y_RNA.106-201 | ENST00000363189 | 100 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-281P-201 | ENST00000384212 | 103 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | Y_RNA.490-201 | ENST00000384413 | 102 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-939P-201 | ENST00000384634 | 107 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU1-139P-201 | ENST00000391307 | 165 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-1186P-201 | ENST00000410429 | 97 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC004965.1-201 | ENST00000413033 | 213 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | LINC00428-201 | ENST00000415620 | 227 nt | TSL 5 BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC010154.1-201 | ENST00000425857 | 269 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL135790.2-201 | ENST00000437701 | 267 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC008080.3-201 | ENST00000440074 | 380 nt | TSL 3 BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | TRAPPC2P8-201 | ENST00000440676 | 396 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTND4P18-201 | ENST00000447010 | 465 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL357873.1-201 | ENST00000449215 | 282 nt | TSL 3 BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | LINC01201-202 | ENST00000451431 | 401 nt | TSL 3 BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | NDUFAF4P4-201 | ENST00000454883 | 502 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | snoU13.23-201 | ENST00000458863 | 104 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC026782.1-201 | ENST00000512952 | 449 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-1114P-201 | ENST00000516022 | 107 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA31.10-201 | ENST00000516482 | 106 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU1-142P-201 | ENST00000516682 | 145 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC015712.3-201 | ENST00000559380 | 164 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC025887.1-201 | ENST00000578349 | 264 nt | TSL 3 BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR5701-3-201 | ENST00000578890 | 82 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR4298-201 | ENST00000584380 | 73 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR5701-1-201 | ENST00000585138 | 82 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC100812.1-201 | ENST00000607622 | 580 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC005014.2-201 | ENST00000607795 | 599 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC084782.3-201 | ENST00000612282 | 578 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | CENPF-206 | ENST00000614578 | 528 nt | TSL 5 BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR5701-2-201 | ENST00000615634 | 82 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTND5P35-201 | ENST00000557537 | 1720 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC025539.1-201 | ENST00000515343 | 4019 nt | TSL 2 BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA40.6-201 | ENST00000391153 | 128 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-510P-201 | ENST00000391239 | 108 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR548K-201 | ENST00000408406 | 116 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR548F5-201 | ENST00000408421 | 86 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL591704.2-201 | ENST00000421658 | 181 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC121342.1-201 | ENST00000423914 | 550 nt | TSL 3 BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | USP9YP16-201 | ENST00000430287 | 407 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTND1P4-201 | ENST00000435196 | 415 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPS3AP52-201 | ENST00000435639 | 297 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | USP9YP23-201 | ENST00000455085 | 407 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |