Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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VAMP3Q15836 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
VAMP3Q15836 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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VAMP3Q15836 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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VAMP3Q15836 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
VAMP3Q15836 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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