Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMAD1Q15797 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMAD1Q15797 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms