Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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SNX17Q15036 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SNX17Q15036 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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SNX17Q15036 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SNX17Q15036 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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